鉴于司法实践中环境污染犯罪的主观罪过形式通常表现为故意，故《最高人民法院、最高人民检察院、公安部、司法部、生态环境部关于办理环境污染刑事案件相关问题座谈会纪要》（以下简称《办理环境污染刑事案件纪要》）对判断行为人有没有环境污染犯罪的故意作出专门规定：

　　一是综合分析判断规则。《办理环境污染刑事案件纪要》规定：判断嫌疑犯、被告人有没有环境污染犯罪的故意，应当依据嫌疑犯、被告人的任职情况、职业经历、专业背景、培训经历、本人因同类行为受到行政处罚或者刑事追究情况及污染物种类、污染方式、资金流向等证据，结合其供述，做综合分析判断。

　　二是主观故意推定规则。根据《办理环境污染刑事案件纪要》的规定，具有以下情形之一，嫌疑犯、被告人不能作出合理解释的，可以认定其故意实施环境污染犯罪，但有证据证明确系不知情的除外：（1）企业没有依法通过环境影响评价，或者未依法取得排污许可证，排放污染物，或者已经通过环境影响评价并且防治污染设施验收合格后，擅自更改工艺流程、原辅材料，导致产生新的污染物质的；（2）不使用验收合格的防治污染设施或者不按规范要求使用的；（3）防治污染设施出现故障，发现后不及时排除，继续生产放任污染物排放的；（4）生态环境部门责令限制生产、停产整治或者予以行政处罚后，继续生产放任污染物排放的；（5）将危险废物委托第三方处置，没有尽到查验经营许可的义务，或者委托处置费用明显低于市场行情报价或者处置成本的；（6）通过暗管、渗井、渗坑、裂隙、溶洞、灌注等逃避监管的方式排放污染物的；（7）通过篡改、伪造监测数据的方式排放污染物的；（8）其他足以认定的情形。

　　根据《办理环境污染刑事案件纪要》的规定，对于行为人已经着手实施非法排放、倾倒、处置有毒有害污染物的行为，由于有关部门查处或者其他意志以外的原因未得逞的情形，可以污染自然环境罪（未遂）追究刑事责任。

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